Eine Technik, die überlappende geklonte DNA identifiziert Fragmente dieses Formular eine kontinuierliche Segment eines Chromosoms. Diese Fragmente erzeugt werden, durch zufällige Scheren oder durch teilweise Verdauung mit einem vier-Base-paar-Fräser wie Sau 3A. Eine Reihe von Kolonie Hybridisierung erfolgt dann, beginnend mit einigen geklonte Fragment, die bereits identifiziert wurde und die ist bekanntermaßen in der Region durch die überlappenden Klone umfasste. In diesem identifizierten Fragment wird verwendet, wie eine Sonde auszuwählen klont mit angrenzende folgen. Diese dienen dann selbst Sonden Klone, die Durchführung von Sequenzen, die neben ihnen und so weiter zu identifizieren. Bei jeder Runde der Hybridisierung eine "Wanderungen" weiter entlang dem Chromosom aus dem ersten Fragment.