Der CEO von Apple Inc. kam im März 1998 als SVP (Senior Vice President) of Worldwide Operations zu Apple und arbeite auch als EVP (Executive Vice President) of Worldwide Sales and Operations und war COO (Chief Operating Officer), bis er am 24. August 2011 zum CEO von Apple ernannt wurde. Er ist der Nachfolger von Steve Jobs, der am 5. Oktober 2011 an Bauchspeicheldrüsenkrebs starb. Cook war vorher schon stellvertretender CEO von Apple, nachdem sich Jobs aufgrund seiner Krankheit im Januar 2011 aus dem Unternehmen zurückzog.

Anfang 2012 erhielt er ein Aktienpaket mit 1 Million Aktien, die er jeweils 2016 und 2021 jeweils zur Hälfte vom Board of Directors von Apple ausgezahlt bekommt. Aktuell haben diese Aktien einen Wert von 378 $ Wert und somit ist Cook der höchstbezahlteste CEO der Welt.

Cook wuchs in Robertsdale, in der Nähe von Mobile, Alabama, auf. Sein Vater war Werftarbeiter, seine Mutter Hausfrau. Cook machte seinen Abschluss an der Robertsdale High School, erwarb 1982 einen BS (Bachelor of Science) in Wirtschaftsingenieurwesen an der Auburn University und 1988 einen MBA (Master of Business Administration) an der Fuqua School of Business der Duke University.

Zunächst arbeitete Cook bei Apple als Senior Vice President of Worldwide Operations. Laut CNN bestand seine Aufgabe darin, „den katastrophalen Verhältnissen bei der Fertigung, dem Vertrieb und der Lieferung der Geräte ein Ende zu setzen“. Cook wird zugeschrieben, Apple durch die Schließung von Fabriken und Lagerhäuser in der ganzen Welt aus der Fertigung herausgenommen zu haben. So konnte das Unternehmen Lagerbestände reduzieren und seine Lieferkette so optimieren, dass sie genauso effizient arbeiten wie Dell Inc. Diese Initiativen waren der Schlüssel zum Erfolg von Apple. Dieser besteht darin, Produkte der nächsten Generation auf den Markt zu bringen und erst darüber zu sprechen, wenn sie für den Einzelhandel bereit sind, es wird die Nachfrage prognostiziert und genau entgegengesetzt zu diesen Prognosen gehandelt. Cook wird wie folgt zitiert „Sie müssen alles wie im Milchgeschäft verwalten. Wenn das Haltbarkeitsdatum abgelaufen ist, haben Sie ein Problem“.

Im Januar 2007 wurde Cook zum COO.

2004 war Cook 2 Monate CEO, als Jobs wegen Bauchspeicheldrüsenkrebs behandelt wurde. 2009 war er wieder für mehrere Monate CEO von Apple, als sich Jobs einer Lebertransplantation unterzog.

Im Januar 2011 genehmigte das Board of Directors von Apple eine dritte Beurlaubung Jobs aus medizinischen Gründen. Während dieser Zeit war Cook für den Großteil des Tagesgeschäfts von Apple verantwortlich, während Jobs die meisten wichtigen Entscheidungen traf. Nachdem Jobs als CEO zurückgetreten ist und Vorstandsvorsitzender wurde, wurde Cook am 24. August 2011 zu CEO von Apple Inc. ernannt.

Cook sitzt außerdem im Vorstand von Nike.

Im April 2012 nahm das Time Magazine Cook in seine jährliche Top 100 der weltweit einflussreichsten Personen auf.

Am 29.Oktober 2012 nahm Cook wichtige Änderungen im Führungsteam des Unternehmens vor. Scott Forstall trat als Senior Vice President von iOS zurück und wurde bis zu seinem geplanten Ausscheiden aus dem Unternehmen im Jahr 2013 Berater von Cooks. John Browett, der SVP of Retail war, wurde nach sechs Monaten auf dem Posten entlassen (er erhielt 100.000 Aktien im Wert von 60 Millionen $). Forstalls Aufgaben wurden auf vier andere Apple-Führungskräfte aufgeteilt: Design SVP Jonathan Ive übernahm die Leitung des Teams von Apple Human Interface, Craig Federighi wurde der neue Leiter des iOS Software-Engineering, Services Chief Eddy Cue übernahm die Verantwortung für Maps und Siri und Bob Mansfield (zuvor SVP of Hardware Engineering) kam in das Unternehmen zurück und wurde Leiter der Gruppe für zukünftige Produkte. Diese Entwicklung war Folge der Bekanntgabe der Umsätze für Q3, die jetzt das zweite Mal in Folge hinter den Erwartungen zurück blieben. Ein Kommentator sagte, dass Forstall gezwungen wurde, eine Stufe nach unten zu steigen, da Cook „beschlossen hatte, energisch durchzugreifen, da die interne Politik und die Unstimmigkeiten einen neuen Höhepunkt erreicht hatte“. Cook arbeitete seit seiner Ernennung zum CEO darauf hin, eine Kultur der Harmonie aufzubauen. Das bedeutete „die Entfernung von Menschen mit unangenehmen Persönlichkeiten — Menschen, die Jobs tolerierte und eng mit ihnen zusammenarbeitete, wie z. B. Forstall“. Ein Journalist sagte jedoch, dass „die Fähigkeit von Apple, Innovationen zu entwickeln, gerade auf diesen Spannungen und Meinungsverschiedenheiten beruhte.“