Samomaskirajući virusi nastoje da se sakriju od antivirusnih programa. Većina antivirusnih programa pokušava da otkrije viruse traženjem određenih obrazaca (poznatim pod imenom "potpis virusa") koji su jedinstveni za svaki virus. Samomaskirajući virusi pri svakom delovanju koriste drugačije šifriranje svojih karakterističnih tekstualnih nizova. Videti i: samomodifikujući virusi, kriptovani virusi.